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默瑞新聞
重組酶聚合酶擴增(RPA)–核酸擴增的另一種選擇
作者:Morey 發(fā)布時間:2018-12-06 點擊次數(shù):8536

      默瑞生物是TwistDx Inc品牌的中國代理商,歡迎大家咨詢訂貨。

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  TwistDx 的重組酶聚合酶擴增 (RPA) 將徹底改變在資源有限的現(xiàn)場環(huán)境中擴增和檢測核酸的能力。

  公司背景

  TwistDx Inc. 由分子生物學(xué)家兼蛋白生物化學(xué)家 Niall Armes 博士以及 Derek Stemple 博士和 Nagesh Mahanthappa 博士于 1999 年共同創(chuàng)立,其總部位于美國馬薩諸塞州劍橋市。TwistDx Limited 于 2002 年成立,其公司位于英國劍橋,2010年被IVD行業(yè)POCT巨頭美艾利爾Alere收購,Alere在2017年4月被雅培Abbott收購。

  RPA技術(shù)原理:

  RPA 體系的重點是重組酶,這些酶與寡核苷酸引物形成復(fù)合體,并使引物與雙鏈 DNA 中的同源序列配對。單鏈 DNA 結(jié)合 (SSB) 蛋白與被取代的 DNA 鏈結(jié)合,并使形成的 D 環(huán)保持穩(wěn)定。然后從引物啟動由聚合酶介導(dǎo)的 DNA 擴增,但前提是存在靶標(biāo)序列。一旦啟動,擴增反應(yīng)將快速進行,因此開始時只需一點靶標(biāo)DNA 拷貝數(shù),高特異性 DNA 擴增在數(shù)分鐘內(nèi)即可達(dá)到可檢出水平。

  RPA循環(huán)

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  RPA 的技術(shù)特點

  為什么選擇RPA方法?

  速度

  RPA 非常快速,在 37-42°C 這一通常最適宜的反應(yīng)溫度下,只需少量核酸分子即可在 3-10 分鐘(通常)內(nèi)擴增至可檢出水平,但這將取決于靶標(biāo)大小。在大部分情況下,只需要一個人即可在半小時內(nèi)采集樣本、制備樣本、運行檢測并取得結(jié)果,并且無需專業(yè)培訓(xùn)。

  靈敏度

  RPA 可檢測復(fù)合樣本中的單拷貝 DNA 和10拷貝甚至更少 RNA,而無需預(yù)先純化核酸。

  特異性

  RPA 具有高度特異性,該技術(shù)可從可能含有數(shù)百納克來自多個不同物種的不相關(guān)復(fù)合基因組 DNA(包括人 DNA)的樣本中識別并擴增單個 DNA 分子,抗干擾能力強。

  恒溫運行

  RPA 在恒定的低溫(37-42°C 最適宜)下運行。對于某些應(yīng)用,如果需要,即便體溫也可支持 RPA 擴增。該反應(yīng)在偏離溫度及低溫設(shè)置下也表現(xiàn)穩(wěn)健,即使在常規(guī)室溫 25°C 下也將奏效,雖然反應(yīng)速度會下降;在此溫度下,只要此生物化學(xué)過程被正確配置,仍可在一小時內(nèi)獲得結(jié)果。

  樣本容差

  RPA 對樣本類型的要求寬松,有時可直接檢測未經(jīng)核酸純化的原始樣本,例如血液、鼻拭子或培養(yǎng)基。通常,只需采用基本的病原體裂解方法處理樣本以釋放核酸即可,例如熱處理或弱堿處理。RPA 對某些復(fù)合樣本類型的寬容性使該技術(shù)非常適合廣泛的現(xiàn)場實地應(yīng)用。

  廣泛的適用性

  RPA 能夠方便地應(yīng)用于任何 DNA 或 RNA 靶標(biāo),無序列偏好性,這一點對于NGS尤其重要。如RPA體系和逆轉(zhuǎn)錄酶結(jié)合使用,則可以進行RNA一步法檢測。

  多重檢測:

  通過將多種引物同時添加到同一反應(yīng)管中,單次 RPA 測試即可擴增和檢測多種不同的靶標(biāo)。

  低設(shè)備成本:

  RPA 僅需要基本的檢測設(shè)備,也就是說,最終用戶可以使用RPA技術(shù)開發(fā)出適合各種應(yīng)用和環(huán)境的人性化診斷方法和試劑盒。

  靈活的試劑形態(tài)

  核心反應(yīng)組分能夠以穩(wěn)定的干燥形態(tài)供貨,該形態(tài)易于運輸,且無需冷藏即可儲存最多 12 個月(穩(wěn)定性可能因用途不同而有變化,因此仍建議在冷藏條件下長期儲存),也能夠以 PCR 試劑更常見的液體形態(tài)供貨,該形態(tài)允許用戶針對特定的應(yīng)用改變反應(yīng)體積和組分比例。

  多種檢測形式

  RPA 可應(yīng)用于各種檢測系統(tǒng)和儀器,包括實時熒光探針和夾心法等形式。

  RPA 與 其他核酸擴增方法PCR及LAMP的比較

  

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  產(chǎn)品系列:

  TwistAmp? 凍干研發(fā)試劑盒

  TwistAmp? 試劑盒(隨附凍干試劑)的試劑形態(tài)具有高度便利性,非常適合在現(xiàn)場、床邊等環(huán)境中使用,而且特別適用于無法維持冷鏈的情況下。TwistAmp? 研究試劑盒包含使用最終用戶設(shè)計的特定引物進行核酸擴增時所需的所有試劑。

  包含凍干試劑的 TwistAmp? 試劑盒具有以下優(yōu)勢:

  · *RPA 擴增溫度要求低,允許使用低成本、便于攜帶的檢驗設(shè)備。

  · *干 RPA 試劑足夠穩(wěn)定,可以在室溫下運輸。

  · *允許多種“適宜現(xiàn)場的”檢測輸出技術(shù),例如側(cè)向?qū)游黾夹g(shù)和熒光技術(shù)。

  · *RPA 對一些復(fù)雜樣本類型表現(xiàn)出高度穩(wěn)健性(即樣本耐受性),更適合于許多不同的現(xiàn)場實地應(yīng)用。

  除了在現(xiàn)場實地使用中的優(yōu)勢,通過 TwistAmp? 試劑盒還便于為許多應(yīng)用和用途開發(fā)出快速、特異且靈敏的 DNA 和 RNA 檢測方法。

  

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  TwistAmp? Basic

  TwistAmp? Basic 試劑盒可實現(xiàn) DNA 擴增。包含 DNA 擴增所需的所有酶和試劑,用戶只需提供引物和模板。TwistAmp? Basic 已被用于固相、加尾引物、配基、電化學(xué)和微陣列等應(yīng)用。

  非常適用于:終點凝膠電泳 DNA 檢測、下游應(yīng)用(例如亞克隆)

  Product code: TABAS03KIT

  Features

  快速 DNA 檢測

  單個分子檢測

  超靈敏

  多重檢測

  96 次反應(yīng)

  TwistAmp? exo

  TwistAmp? exo 試劑盒可實現(xiàn)實時熒光 DNA 擴增。若想要以均相形式將 TwistDx RPA 擴增技術(shù)與 TwistDx 專利熒光 TwistAmp? exo 探針結(jié)合使用,則推薦使用本產(chǎn)品。用戶只需提供引物、探針和模板。更多信息請參閱手冊。

  非常適用于:實時熒光 DNA 檢測

  Product code: TAEXO02KIT

  Features

  快速 DNA 檢測

  實時探針檢測

  單個分子檢測

  多重檢測

  96 次反應(yīng)

  TwistAmp? nfo

  TwistAmp? nfo 試劑盒可實現(xiàn)橫向流動檢測用 DNA 擴增。若想要通過終點夾心法(例如橫向流動 [LF] 試紙條)檢測有效 DNA 擴增反應(yīng)的產(chǎn)物,則適合使用本產(chǎn)品。用戶只需提供引物、探針和模板。

  非常適用于:開發(fā)低成本的現(xiàn)場側(cè)向?qū)游鰴z測方法。

  Product code: TANFO02KIT

  Features

  終點檢測

  單個分子檢測

  與橫向流動試紙條兼容

  多重檢測

  96 次反應(yīng)

  Twist Amp? Liquid 研發(fā)試劑盒

  TwistAmp? Liquid 是為了提供散裝液體形態(tài)的核心 RPA 組分,最終用戶能夠以不同的比例混合這些組分,以便用戶為各自的應(yīng)用配制預(yù)混液*。

  TwistAmp? Liquid 具有以下優(yōu)勢:

  最終用戶可自由調(diào)整預(yù)混液制備量,而不再被局限于凍干試劑的固定體積

  最終用戶可自由調(diào)整反應(yīng)體系中的組分比例,這使 RPA 試驗開發(fā)工作具有更大的靈活性

  TwistAmp??Liquid Basic 是一款最適合用于凝膠分析或者作固相、加尾引物、適配體、電化學(xué)和微陣列應(yīng)用的 DNA 擴增試劑盒。TwistAmp??Liquid exo 是一款用于以實時熒光檢測擴增反應(yīng)的 DNA 擴增試劑盒。

  

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  TwistAmp? Liquid Basic

  以靈活的液體形態(tài)實現(xiàn) DNA 擴增。包含 DNA 擴增所需的所有酶和試劑,用戶只需提供引物、dNTP 和模板。更多信息請參閱手冊。

  非常適用于:終點凝膠電泳 DNA 檢測、下游應(yīng)用(例如亞克隆)、便于使用不同的 RPA 反應(yīng)體積或改變組分比例

  Product code: TALQBAS01

  Features

  快速 DNA 檢測

  靈活的反應(yīng)體積

  靈活的試劑組分比例

  單個分子檢測

  試劑足夠至少 100 次反應(yīng)使用(取決于使用的體積)

  多重檢測

  TwistAmp? Liquid exo

  以靈活的液體形態(tài)進行實時熒光 DNA 擴增。若想要將 RPA 與 TwistDx 專利熒光 TwistAmp? exo 探針結(jié)合使用,則推薦使用本產(chǎn)品。除了基本的組分,還包含強大的核酸酶(核酸外切酶 III),該酶將在擴增反應(yīng)期間處理 TwistAmp? exo 探針并產(chǎn)生實時讀出。用戶只需提供引物、探針、dNTP 和模板。

  非常適用于:實時熒光 DNA 檢測,便于使用不同的 RPA 反應(yīng)體積或改變組分比例

  Product code: TALQEXO01

  Features

  快速 DNA 檢測

  實時探針檢測

  靈活的反應(yīng)體積

  靈活的試劑組分比例

  單個分子檢測

  試劑足夠至少 100 次反應(yīng)使用(取決于使用的體積)

  多重檢測

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